污水處理中的微生物種類很多，主要有菌類，藻類以及動(dòng)物類。

（1）細(xì)菌

細(xì)菌是單細(xì)胞的原核生物。細(xì)胞內(nèi)有細(xì)胞質(zhì)，由蛋白質(zhì)、碳水化合物和其他有機(jī)化合物的膠體懸浮液組成。細(xì)胞質(zhì)內(nèi)還有脫氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）。細(xì)菌包括桿菌、大腸埃希菌、球菌、螺旋菌、弧菌屬等。

（2）原生動(dòng)物

原生動(dòng)物是可以活動(dòng)的微小真核生物，通常為單細(xì)胞。大部分原生動(dòng)物是好氧異養(yǎng)生物，只有少數(shù)是厭氧的。原生動(dòng)物比細(xì)菌大一個(gè)數(shù)量級(jí)，并往往以消耗細(xì)菌為能源。原生動(dòng)物包括變形蟲屬、簡(jiǎn)便蟲屬等。

（3）真菌/酵母菌

真菌是多細(xì)胞、非光合的異養(yǎng)真核生物，大多數(shù)真菌是好氧微生物，并具有降解纖維素的能力，對(duì)污泥堆肥有重要作用。酵母菌是真菌，但屬單細(xì)胞生物。

（4）蠕蟲

十二指腸鉤蟲、人蛔蟲、毛首鞭形線蟲等。

（5）病毒

病毒是由核糖核酸核心（DNA或RNA）組成，寄生于其他生物的細(xì)胞內(nèi)，包括MS2、腸道病毒、諾沃克因子、輪狀病毒等。

（6）古菌

古菌大小和細(xì)胞成分類似于細(xì)菌，對(duì)厭氧過程很重要。

（7）輪蟲

輪蟲屬好氧異養(yǎng)動(dòng)物的真核生物。它對(duì)于消耗分散、絮凝的細(xì)菌和小顆粒有機(jī)物質(zhì)非常有用。

（8）藻類

藻類是單細(xì)胞或多細(xì)胞，自養(yǎng)光合型的真核生物。在廢水處理中，藻類通過光合作用產(chǎn)生氧的能力是水生態(tài)環(huán)境的生命所在。

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